O herbário foi fundado em 1963 junto com o Departamento de Botânica da Universidade de Brasília (UnB). É o maior herbário da região Centro-Oeste. Trata-se de uma rica coleção de espécimes vegetais desidratados e montados em cartolina na forma de exsicatas, preservadas sob baixa temperatura, em ambiente controlado. Dentro da coleção, as amostras são organizadas em famílias, gêneros e espécies ordenadas alfabeticamente. Segundo os dados do CRIA (Centro de Referência em Informação Ambiental) a coleção conta com aproximadamente 241.741 registros informatizados, sendo 1.818 Tipos (ilustração ou exsicata ao qual um nome está permanentemente ligado). Porém o herbário ainda se encontra em processo de digitalização de suas amostras e estima-se que, pelo menos mais 200.000 amostras ainda não foram digitalizadas. Eminentes botânicos já foram curadores da coleção, como a Dra. Graziela Maciel Barroso, cedida pelo Jardim Botânico do Rio de Janeiro em 1960, tendo permanecido até 1968. Dra. Graziela foi substituída pelo famoso botânico amazônico João Murça Pires. O americano Dr. George Eiten, importante pelas publicações pioneiras no estudo da Vegetação do Cerrado, veio para a UnB em 1971 tendo contribuído com o Departamento até quase sua morte, em 2012. De 1993 a 2008 a 2019 a curadoria do UB foi exercida majoritariamente pela Drª Carolyn Proença, que contribuiu com a coleta de inúmeros espécimes botânicos para o acervo e, pelo trabalho hercúleo de identificação de mais de 9000 plantas! Atualmente o herbário tem como curadores a Drª Regina Célia de Oliveira, curadora de Fanerógama, Drª Maria da Graça de Souza Machado, Curadora de Criptógamas e Dr. Paulo Eduardo Aguiar Saraiva Câmara, Curador Briófitas. Além da coleção de Fanerógamas, o Acervo conta com uma de Criptógamas, Xiloteca e Carpoteca (coleção de frutos).